解放战争时期，国统区实施的文物保护维修工作主要集中在北平等地。北平光复后，国民政府组织文物整理委员会，隶属于国民政府行政院，并在北平市工务局设文物整理工程处，负责具体业务工作。1947年元月，文物整理工程处移交给文物整理委员会，由委员决定文物整理项目的选择及编制工程预算，文物整理工程处负责组织实施。期间，相继组织实施了天安门及天安门前东西三座门、颐和园围墙、永定门城楼、箭楼、东西长安街牌楼、颐和园辉王宇牌楼及香海真源、智化寺智化殿、西配殿及天王殿、北海四角亭、天安门石桥、碧云寺钟鼓楼、安定门箭楼、故宫午门东雁翅楼等近20项文物保护维修工程。

　　作为中国古建筑调查研究领域的领军机构，抗日战争胜利后，中国营造学社“社员泰半离职”，只余梁思成、刘致平、莫宗江、罗哲文等人北上，与清华大学营建系合设中国建筑研究所，历时仅一年。因“学校根本无调查经费，又乏助手制图，对于社务，无所建树”朱海北：《中国营造学社简史》，载《古建园林技术》1999年第4期。，辉煌不再，终于停办，中国营造学社至此走完了它17年的光荣历程，在中国近代文物事业发展史上留下了浓墨重彩的一笔。

　　在这一时期，国立敦煌艺术研究所克服困难，坚守岗位，继续开展了一些文物保护和艺术研究活动。1946—1947年，研究所的保护和研究力量得到一定程度的加强，并置办了部分必需器材。据统计，自国立敦煌艺术研究所成立至敦煌解放前，研究所共修整洞窟通道地面146平方米，修防沙墙(沟)30米，清除洞窟前积沙150立方米，安装洞窟门窗30合，修缮壁画150平方米，修缮古代土塔4座，对洞窟进行了平面和立面测量，完成了对莫高窟各洞窟的重新编号，新发现洞窟12个，收集文物231件，编辑图录专著2部，临摹各时代壁画321平方米，临摹各时代彩塑15件，拍摄洞窟及文物黑白照片400张。常书鸿：《敦煌莫高窟的保护维修》，原载1961年5月9日《甘肃日报》，转引自《常书鸿文集》。1949年9月，敦煌解放前夕，为防止溃兵抢劫破坏，研究所组织人力，储备物资，依靠几条旧枪，枕戈待旦，终于迎来了解放，使敦煌文物保护事业获得了新生。

　　解放战争时期，国统区文物学术研究活动相对萧条。1946年3月，张半陶等人在北平发起成立了故都文物研究会，以“稽考阐扬并发展故都之文物，而期充实民族文化，协进建国工作”为宗旨。下设总务处、美术馆、艺术馆、旧文馆等，曾开展过整理藏品、举办文物展览、调查曲阜孔庙乐器等活动，出版有《故都文物研究会汇报》。1946年10月，裴文中在沈阳做了题为“中国远古文化与东北原人”的学术讲演。同年，张筱衡撰写了《梁惠王西河长城考》，指出魏河西长城止于陕西韩城县黄河之滨，解决了魏国固阳今地的悬案，纠正了前人的误释。景爱：《中国长城史》，第10—11页，上海人民出版社，2006年。1947年1月，中国纸币集藏会成立于上海，该会以“研究古今纸币、交换知识、联络友谊为宗旨”。编辑出版有会刊《中币会刊》，共出两卷30期;《钞票世界》共出三期，此外还编写发行了《集钞小丛书》20册，内容有《各省银行钞集》、《八行商业钞集》、《军用纸币钞集》、《铜元角票钞集》和《客钞洋商钞集》等;1947年，国立中央研究院化学所对安阳小屯出土的8件箭头、刀柄、戈身等青铜器进行了包括锡、铅、铜、铁、锌、镍等项目在内的成分分析;1947年至1948年，商务印书馆相继出版了中央研究院历史语言研究所编辑的《田野考古报告》第二、三册。1948年，北平研究院苏秉琦出版了《斗鸡台沟东墓葬》及《图说》，这是中国学者利用考古资料探讨先周文化的开始，也为中国学者进行陶器类型学上的分类排比建立了典范。蔡凤书：《中日考古学的历程》，第82页，齐鲁书社，2005年。同年，黄文弼出版了《罗布淖尔考古记》。1949年，安志敏在《燕京学报》上发表了《砂锅屯洞穴层位之研究》。