2020年春节前夕，突如其来的新型冠状病毒肺炎疫情蔓延全国。在市委、市政府和市文广旅局的正确领导下，邳州博物馆积极应对，主动作为，一手抓文物安全，一手抓文化服务，坚决打赢疫情防控阻击战。
疫情就是命令，防控就是责任。接上级通知临时闭馆后，邳州博物馆迅速成立疫情防控工作领导小组，针对自身工作实际制定疫情防控应急预案，明确具体任务和工作措施，扎实开展疫情防控工作。
为确保人民群众生命安全，邳州博物馆第一时间向社会发布闭馆公告，取消馆内相关活动和对外开放，及时对全馆干部职工有无湖北武汉接触史进行排查，紧急购买口罩、84消毒液、酒精等防疫物资发放给职工、保洁及保安人员，坚持每天对馆内外地面、围墙、门岗、卫生间、办公室、监控室等地进行全方位消杀，确保馆内及周边不留死角。
在加强疫情防控工作的同时，邳州博物馆继续绷紧文物安全弦，将安全值班工作列为重点，每日由馆领导带队，加强值班值守，抓实常规巡查，尤其加强对关键部位重点时段的监控，做到“守土有责，守土尽责”，有力确保了馆内文物安全。同时，邳州博物馆党员干部还充分发挥先锋模范作用，白天在博物馆值班，下班后到社区参加防控值守，协助社区工作人员开展出入检查、体温测量、防疫知识宣传、劝散聚集人群等工作，全面落实联防联控措施，筑牢疫情防控的坚强防线，以实际行动践行初心使命。
线下闭馆控疫情，线上展览送温馨。为丰富市民疫情防控期间的精神文化生活，邳州博物馆主动创新社会服务形式，利用精心策划推出“云观展”服务，切实加强线上展览信息的宣传推广，让公众足不出户即可体验网上看展览、赏文物，确保闭馆期间服务不缺位，内容不打折。据统计，临时闭馆期间，邳州博物馆官网已累计推送各类信息及数字展览200余条（个），点击量超过36000人次，有力鼓舞了广大群众抗击疫情的决心和勇气。